O Programa de Educação Ambiental “Na Trilha das Águas”, realizado pelo SAAE desde 2009, em parceria com a Secretaria Municipal de Educação, leva os alunos do ensino fundamental para percorrem locais históricos do abastecimento de água de Indaiatuba.
Também participam do programa, alunos das redes municipal e particular, universidades, empresas, associações de classe, mediante agendamento prévio.
Neste programa os participantes conhecendo de perto como é feita a captação e o tratamento de água. Recentemente foi adicionado ao percurso o Museu da Água, onde seguem todo o roteiro do espaço, guiados pelos monitores.
A visita começa na Represa de Captação do Cupini, próxima à SP-75, onde fica o Museu da Água. Os grupos são recepcionados por monitores que dão uma aula aos visitantes, explicando desde a parte histórica da visita até percorrerem trilhas em um dos últimos trechos remanescente de Mata Atlântica do município, moradia de várias espécies de aves e roedores, além de conhecerem inúmeras nascentes existentes naquela área, que alimentam um dos lagos do local, de onde a água é captada para tratamento desde 1937.
Está ação busca criar cidadãos com forte consciência ambiental, que tenham o cuidado necessária para a utilização de um recurso tão importante para a humanidade e que terá um papel cada dia maior no desenvolvimento tanto do indivíduo como de uma região.